一、作用不同

公司章程：每个公司都应制定的文件，是公司的宪章和组织行为的基本准则；公司章程与“公司法”共同调整公司的活动秩序。

股东协议：公司股东之间签订的协议。主要为明确每个股东的权利义务、公司成立后的治理方式，以及股东之间的违约责任。调整的是股东之间的权利义务。

二、适用法律不同

公司章程：属于公司文件，适用《公司法》的规定。

股东协议：属于民事合同，适用《民法典》的相关规定。

三、是否法定不同

公司章程：是公司成立的必备文件，注册公司时必须提交公司章程。

股东协议：不是设立公司的必备文件，没有股东协议不影响公司的设立。

四、是否公开不同

公司章程：公司章程须在市监局备案，当事人可凭相关文书调阅，属于准开性文件。

股东协议：股东的内部协议，一般不会对外公开。

五、适用对象不同

公司章程：对公司、股东、董事、监事以及高级管理人员都具有拘束力，公司章程的适用对象是法定的，不以当事人签名盖章为适用前提。例如，继受股东、新股东，没有在章程上签字，仍要受章程拘束。董监高没有在公司章程上签名，仍须对公司负有忠实勤勉义务。

股东协议：只对协议上签名的人具有法律效力。

六、签署主体不同

公司章程：制定时由全体股东签署，修改时由持2/3以上表决权的股东签署。

七、效力期间不同

公司章程：始于公司成立之日，终于公司注销之日。

股东协议：效力期间由股东自行约定。

八、修订方式不同

公司章程：持有2/3表决权（股份）的股东同意。

股东协议：签署协议的全体股东协商一致才能修改。

九、能否解除不同

公司章程：不能自行解除，也不能申请法院解除。

股东协议：协议约定的解除事由出现时，协议自然解除。

十、法律后果不同

公司章程：违反公司章程，除了承担民事责任外，还可能面临行政处罚或被追究刑事责任。

股东协议：违反协议的，一般仅须承担民事违约责任。